Võitjad kuulutatakse välja 28. jaanuaril Nordea Kontserdimajas toimuval auhinnatseremoonial, millest teeb otseülekande TV3. Galaõhtut juhivad Karl-Erik Taukar ja Liis Lemsalu.
Hääletus toimus kahe nädala jooksul ja viidi läbi kahes voorus. Kõik žüriiliikmed said hääletuse käigus teha omapoolseid ettepanekuid. Žürii häältest moodustus pingerida, mille esimesed kohad avalikustatakse nominentidena ning enim hääli saanud album, laul või muusikavideo võidab.
Eesti Muusikaauhinnad 2016 nominendid tähestikulises järjekorras:
Aasta Klassikaalbumi (auhinnale kandideerivad nelja klassikalise muusika alamkategooria hääletustulemuste parimad):
GESUALDO: Eesti Filharmoonia Kammerkoor, Tallinna Kammerorkester, dirigent Tõnu Kaljuste – Carlo Gesualdo, Erkki-Sven Tüür, Brett Dean
Lepo Sumera. Klaverimuusika. Esitab Kadri-Ann Sumera, kaasategevad Hanna Heinmaa, Eesti Riiklik Sümfooniaorkester, dirigent Arvo Volmer
Parim Sümfoonilise või Lavamuusika Album
Martin Kuuskmann, Northwest Sinfonia, dirigent Barry Jekowsky, Tallinna Kammerorkester, dirigent Risto Joost – Theofanidise, Hummeli, Mozarti ja Kõrvitsa fagotikontserdid
Parim Kammermuusika Album
Mihkel Poll (klaver), sooloalbum: George Enescu, Béla Bartók, Erkki-Sven Tüür, Tõnu Kõrvits
Jaak Sooäär, Raul Vaigla, Tanel Ruben – 1980
Sofia Rubina – In The Land Of OO-BLA-DEE
Aasta Etno/Folk/Rahvalik album
Mari Kalkun & Runorun – Tii ilo
Avoid Dave – Insert Title
Aasta Alternatiiv/Indiealbum